Plateformes & Technologies

Huit plateformes réservables, de l'échantillon au jeu de données.

Chaque plateforme ci-dessous fonctionne selon des protocoles documentés avec QC à chaque étape. Réservez directement une seule catégorie, combinez-en plusieurs en un projet, ou faites appel à un partenaire nommé pour une technique spécifique.

Déjà client validé, pour une prestation de routine ? L'extraction, le contrôle qualité, la PCR, la qPCR, la dPCR et le séquençage Sanger sont disponibles au prix catalogue sur notre boutique en ligne, directement depuis votre espace client. Sans passer par un devis.

Cadrage scientifique 01 Préparation des échantillons 02 Extraction & QC 03 Génomique 04 Transcriptomique 05 PCR quantitative & Génotypage 06 Protéomique 07 Métagénomique & Microbiome 08 Exosomes & VE Forfaits Multi-Omics Plateformes Combo

Vous ne savez pas par où commencer ?

Décrivez votre projet en une phrase. Nous vous suggérerons la bonne plateforme.

Une recherche rapide par mots-clés dans notre catalogue, single-omics, multi-omics ou combo, pas un substitut à un échange avec notre équipe, mais un premier repère rapide.

Essayez : « vésicules extracellulaires à partir de plasma », « génotypage SNP », « microbiome intestinal + ARN hôte », « génome entier et RNA-seq ensemble »…

Avant de réserver

Cadrage scientifique

Tous les projets ne démarrent pas avec une liste de paramètres claire. Notre service de cadrage vous met en relation avec notre équipe scientifique pour une étude structurée de votre question : bibliographie, une ou plusieurs réunions scientifiques, et une définition écrite du protocole & des paramètres, avant de réserver l'une des plateformes ci-dessous.

Bibliographie & revue de littérature

Une revue structurée des travaux publiés pertinents encadrant votre question et les approches antérieures.

Réunion(s) scientifique(s)

Une ou plusieurs sessions de travail avec notre équipe scientifique pour discuter faisabilité, options et compromis.

Définition des paramètres & du protocole

Une définition écrite des paramètres expérimentaux, des exigences d'échantillon et de la combinaison de plateformes adaptée à votre projet.

Rapport de cadrage (livrable)

Un document écrit que vous conservez, utilisable pour avancer avec nous, ou ailleurs.

Un service payant, réservable comme un créneau de plateforme. Si le projet qui en résulte est réservé avec nous, les frais de cadrage peuvent être crédités sur celui-ci : au cas par cas, confirmé au moment de la réservation. Pour un engagement plus complet avec un responsable de projet dédié jusqu'à la publication, voir le programme Collaborative Research de GenXMap.

Réserver une session de cadrage
01 / 08

Préparation des échantillons

Réception, biobanking et logistique : le point de départ documenté dont dépend chaque projet, réalisé selon une chaîne de traçabilité complète.

Biobanking

Stockage traçable de longue durée pour archivage, ré-analyse et études futures.

Réception & logistique des échantillons

Chaîne de traçabilité documentée, vérification et manipulation sécurisée du transport.

Traçabilité continue

Chaque échantillon enregistré et traçable de la réception au stockage.

Optimisé pour les plateformes en aval

Préparé et acheminé spécifiquement pour la plateforme vers laquelle il se dirige ensuite.

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02 / 08

Extraction & contrôle qualité des échantillons

Extraction d'acides nucléiques/protéines suivie d'un QC rigoureux et documenté à la réception, après extraction et avant librairie. Chaque livrable est accompagné de son rapport QC.

1,8–2,1Pureté (260/280)
QubitVérification de la concentration
BioanalyzerÉvaluation de l'intégrité
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03 / 08

Génomique

Préparation de librairies NGS jusqu'au séquençage du génome entier, de l'exome et de panels ciblés.

Préparation de librairies NGS

Préparation de librairies pour panels génomiques, ciblés et personnalisés.

Séquençage du génome entier & de l'exome

Profilage génomique complet et couverture profonde des régions codantes.

Séquençage ciblé

Panels ciblés pour biomarqueurs, variants et gènes de maladie.

Livraison FASTQ

Livraison de données sécurisée, rapide et fiable via le cloud.

≥ Q30> 90 % des bases
> 99 %Précision
> 80 %Couverture cible (20X)
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04 / 08

Transcriptomique

Séquençage ARN bulk et cellule unique pour le profilage d'expression et l'hétérogénéité cellulaire.

RNA-seq bulk

Profilage à l'échelle du transcriptome, jeux de données prêts pour l'expression différentielle.

RNA-seq cellule unique

Résolution à l'échelle de la cellule unique pour l'hétérogénéité cellulaire et les populations rares.

Analyse d'expression génique

Quantification des transcrits et profilage d'expression.

Validation RT-qPCR

Validation ciblée des transcrits clés issus des données de séquençage.

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05 / 08

PCR quantitative & Génotypage

qPCR et PCR digitale pour une quantification rapide et précise : petits volumes d'échantillon, délai rapide.

qPCR

Quantification relative et absolue avec une haute reproductibilité.

PCR digitale (dPCR)

Quantification absolue pour cibles rares et variants à faible abondance.

Génotypage

Génotypage SNP et dosages du nombre de copies.

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Détection de pathogènes

Tests de détection ciblés pour agents infectieux.

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06 / 08

Protéomique

Analyse au niveau protéique, du Western blot en interne à la protéomique par spectrométrie de masse via notre réseau de partenaires.

Réalisé en partenariat avec notre réseau spécialisé, même point de contact unique, mêmes standards QC.

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07 / 08

Métagénomique & Microbiome

Séquençage métagénomique 16S et shotgun pour le profilage des communautés microbiennes et les études d'interaction hôte-microbiome.

Séquençage 16S rRNA

Profilage taxonomique des communautés bactériennes.

Métagénomique shotgun

Séquençage de la communauté entière pour une résolution fonctionnelle et au niveau de la souche.

Études hôte-microbiome

Transcriptomique de l'hôte combinée au profilage du microbiome pour la recherche sur les maladies infectieuses.

Voir notre page secteur Maladies infectieuses & microbiome pour les applications.

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08 / 08

Exosomes & VE

Isolement et caractérisation des vésicules extracellulaires, et omics en aval sur le contenu des VE.

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Niveau 2 · Forfaits internes

Forfaits Multi-Omics

Combinez deux ou plusieurs de nos 8 propres plateformes en un seul projet coordonné : un seul fil de logistique d'échantillons, un seul point de contact, un seul jeu de données intégré au lieu de livrables séparés à réconcilier vous-même. Les exemples ci-dessous sont des points de départ ; toute combinaison de nos catégories peut être cadrée comme un forfait.

Forfait Multi-Omics

Forfait Génome + Transcriptome

Séquençage du génome entier ou de l'exome associé au profilage transcriptomique sur les mêmes échantillons : appel de variants et données d'expression livrés ensemble, avec un QC partagé et un calendrier coordonné unique.

S'appuie sur : 03 Génomique + 04 Transcriptomique Se renseigner sur ce forfait
Forfait Multi-Omics

Forfait Épigénome + Transcriptome

Profilage chromatine/méthylation réalisé en parallèle du RNA-seq sur des échantillons appariés, conçu pour les études reliant les modifications réglementaires à l'expression génique qu'elles induisent, sans jongler entre deux fournisseurs distincts.

S'appuie sur : 03 Génomique + 04 Transcriptomique Se renseigner sur ce forfait
Découverte de biomarqueurs

Forfait Biomarker Xplorer

Conçu pour les projets de découverte de biomarqueurs. Quand la question scientifique l'exige, ce forfait mobilise l'ensemble des moyens disponibles : les plateformes propres d'OMICS4, la Biologie Computationnelle & IA de GenXMap, et notre réseau de partenaires, cadrés et livrés comme un seul projet coordonné avec un suivi d'échantillons unifié.

S'appuie sur : les plateformes OMICS4, la Biologie Computationnelle & IA de GenXMap, et notre réseau de partenaires, si besoin Cadrer un projet de découverte de biomarqueurs

Les exemples ci-dessus sont des points de départ illustratifs, pas un menu figé. Indiquez-nous votre projet et nous cadrerons la bonne combinaison. Besoin de concevoir et mener tout le projet scientifique, pas seulement de réserver des plateformes : conception de protocole, connexion des bonnes plateformes, intégration de données multi-omics, jusqu'à la publication ? C'est le programme Collaborative Research de GenXMap, avec un responsable de projet dédié de niveau doctorat comme point de contact unique.

Collaborations phares

Plateformes Combo

Certaines capacités vont au-delà de toute catégorie unique ci-dessus, construites conjointement avec un partenaire académique ou industriel nommé autour d'une technique spécifique, distinctes de nos propres forfaits Multi-Omics, qui combinent nos catégories en interne. Chaque plateforme combo s'appuie sur l'une de nos 8 catégories, plus l'expertise et l'équipement dédiés d'un partenaire nommé.

Plateforme Combo

Plateforme de caractérisation des exosomes

OMICS4×Faculté de Pharmacie de Marseille, Aix-Marseille Université

Un workflow dédié de caractérisation des exosomes/VE combinant la capacité d'isolement et d'analyse du contenu d'OMICS4 avec l'équipement spécialisé de caractérisation de nanoparticules de la Faculté de Pharmacie de Marseille, conçu pour un dimensionnement, un comptage et une validation des marqueurs de VE d'une résolution supérieure à ce que chaque partenaire réalise seul.

S'appuie sur : 08 Exosomes & VE Se renseigner sur cette plateforme

Vous ne savez pas quelle plateforme convient à votre projet ?

Indiquez-nous votre type d'échantillon et votre volume. Nous vous recommanderons la bonne plateforme.

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